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天山野果林关键物种DNA条形码数据库（2023年）
  • 2024/12/10 00:46
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中文名称
天山野果林关键物种DNA条形码数据库（2023年）
CSTR
CSTR:33110.11.XIEG.xjsedata.2022.00009108
10.12389/XIEG.XJSEDATA.2024.00100735
数据共享方式
在线下载
数据分类
生物多样性
数据贡献者
杨红兰
数据集摘要

伊犁地区植物DNA条形码序列，包括matK, rbcL和ITS基因序列和峰图。306个植物样本进行测序分析，这些样本分属于65科，204属，274个种。其中包括野生林果植物，野生花卉，药用植物和作物近缘种，珍稀，濒危植物等。MatK, rbcL和ITS测序表明，共获得281个rbcL片段, 281个matK片段和278个ITS片段，每个测序中包含上游引物（_f）和下游引物（_r）

基本信息
采集时间 2023/01/01  -  2023/12/31
采集地点 伊犁地区
数据量 354.9 MiB
数据格式 表格
坐标系
投影 无
数据缩略图
数据源描述

测序原始数据，未经加工处理。

数据加工方法

野外采集植物样本，进行DNA提取，PCR扩增，碱基测序获得。通过测序仪对植物DNA碱基测序，根据峰图判断碱基读取的准确性，去除序列2端不确定的序列，获得可信度高的碱基序列。fasta测序结果可以用文本打开； 峰图文件（AB1格式）可以使用Chromas软件查看。

数据质量描述

关于天山野果林关键物种DNA条形码数据资源遗传材料采集过程依照《县域陆生高等植物多样性调查与评估技术规定》进行人工采集，DNA条形码数据采集参考和引用《关于植物 DNA 条形码研究技术规范》（高连明等，2012）及本次科考生物多样性调查规范相关内容。经过人工检查本年度数据误差值小于0.1%，符合本次科考生物多样性调查规范相关要求。

项目支持信息
# 编号 名称 类型
1 2021xjkk0500 天山野果林生态系统与生物多样性调查 国家科技支撑计划项目
引用和标注
为保障平台科技资源的权益、扩展平台中心的服务、提升科技资源的应用潜力，请资源使用者在使用资源所产生的研究成果中（包括公开发表的论文、论著、数据产品和未公开发表的研究报告、数据产品等成果），请按以下方式规范标注和引用。
天山野果林关键物种DNA条形码数据库（2023年）来源于第三次新疆综合科学考察专项 "天山野果林生态系统与生物多样性调查(2021xjkk0500)"

中文发表的成果中参考以下规范注明： 数据来源于干早区生态与资源科学数据中心 (https://data.dcxjegi.cn)。
英文发表的成果中参考以下规范注明： The dataset is provided by Arid Land Ecology and Resources Science Data Center. (https://data.dcxjegi.cn).

数据引用
杨红兰. 天山野果林关键物种DNA条形码数据库（2023年）. 干旱区生态与资源科学数据中心(https://data.dcxjegi.cn), 2024. https://cstr.cn/CSTR:33110.11.XIEG.xjsedata.2022.00009108.
杨红兰. 天山野果林关键物种DNA条形码数据库（2023年）. 干旱区生态与资源科学数据中心(https://data.dcxjegi.cn), 2024. https://www.doi.org/10.12389/XIEG.XJSEDATA.2024.00100735.
许可协议
知识共享许可协议   本作品采用 知识共享署名 4.0 国际许可协议进行许可。
# 标题 文件大小
1 2023年天山野果林关键物种DNA条形码数据库-数据汇总.xlsx 95.2 KiB
2 2021xjkk0502-01（DNA条形码峰图）
3 2021xjkk0502-01（DNA条形码序列）
暂无记录。
如何获取数据 
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南: 
北: 
导出元数据
数据服务信息
联系人：
李锦
服务电话：
0991-7823121
服务邮箱：
datacenter@ms.xjb.ac.cn
联系信息
数据贡献者：
杨红兰
元数据作者：
杨红兰
数据管理者：
杨红兰

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