昆仑山中段北坡土壤理化性质数据,包括总氮、总磷、总钾、速效氮、速效磷、有效钾、矿物质结合有机碳、颗粒有机碳、pH、电导率、总盐、土壤含水量。
| 采集时间 | 2022/07/01 - 2022/07/31 |
|---|---|
| 采集地点 | 新疆维吾尔自治区和田地区策勒县昆仑山中段北坡(36°10′–36°50′N,80°10′–80°50′E) |
| 数据量 | 17.0 KiB |
| 数据格式 | xlsx格式 |
| 坐标系 |
在昆仑山中段北坡进行取样,分析测试了土壤理化性质。
1、实验设计: 本研究在昆仑山中段北坡(36°10′–36°50′N,80°10′–80°50′E)海拔1707米至3548米之间选择七个样带进行取样,包括荒漠(1707 m)、山地半灌木荒漠(1960 m、2448 m和2746 m)、山地荒漠草原(2905 m)以及高寒草原(3248 m和3548 m)(表1)。在采样期间,1707 m海拔处未发现植物。在1960-2746 m海拔处,植被主要由灌木和半灌木组成,如沙拐枣 (Calligonum roborovskii)、枇杷柴 (Reaumuria soongonica) 和合头草 (Sympegma regelii)。2905 m海拔处的植被属于山地荒漠草原,主要包括针茅 (Stipa capillata)、绢蒿 (Seriphidium rhodanthum) 和芨芨草 (Achnatherum splendens)。3548 m海拔处的植被属于高寒草原,优势植物为紫花针茅 (Stipa purpurea)、细叶嵩草 (Kobresia filifolia) 和委陵菜 (Potentilla)。 2、采样方法: 根据植被类型分类,在海拔3548 m、3248 m和2905 m处,分别设置四个独立的1 m×1 m样方,样方之间水平间隔10 m。在海拔2746 m、2448 m、1960 m和1707 m处,设置四个独立的10 m×10 m大样方,样方之间水平间隔100 m。在每个样方内,调查了植物多样性和植被覆盖度,并采集了植被的地上部分。随后,在移除凋落物后,沿每个样方的对角线随机采集五个表层土芯(0-10 cm)。将这些表层土芯混合形成一个混合样品。总计从七个不同海拔水平的样方中采集了28份土壤样品。在土壤采样过程中,始终佩戴一次性手套,并在采集每个样品前用75%酒精对土钻进行消毒。将土壤样品带回实验室后,为避免交叉污染,使用经紫外线消毒30 min的2 mm筛网对不同海拔的土壤进行过筛。之后,将土壤样品分成两份:一份用于风干以分析理化性质,另一份则储存于-20℃下,用于后续的土壤微生物DNA提取。 3、分析过程: 采用E.Z.N.A.® Soil DNA Kit提取土壤DNA,利用TBS-380荧光计测定DNA浓度,NanoDrop 2000检测纯度,1%琼脂糖凝胶电泳评估完整性。DNA经Covaris M220打断至约400 bp,构建双端测序文库,并在Illumina NovaSeq PE150平台进行宏基因组测序。测序数据已上传至国家基因组科学数据中心GSA数据库(PRJCA017392)。 原始序列经Fastp进行质量控制,采用MEGAHIT完成序列组装,利用Prodigal预测开放阅读框(ORF),筛选长度≥100 bp基因并翻译为氨基酸序列。通过KEGG数据库注释碳循环相关功能基因,并采用SOAPaligner聚类构建非冗余基因集(95%序列一致性)。利用HMMER进行CAZyme功能注释,将其划分为GHs、GTs、CEs、CBMs、PLs和AAs六类酶家族;采用RPKM标准化基因丰度,计算功能基因α和β多样性,并结合Diamond和NR数据库开展优势类群物种注释。 所有统计分析在R 4.2.1中完成。采用单因素方差分析和Duncan检验比较不同海拔间功能基因、微生物及环境因子的差异;利用Shannon指数评估α多样性,线性回归分析海拔、多样性及功能基因丰度间关系;通过PCoA和PERMANOVA分析群落组成及酶组成差异。进一步采用RDA、VPA、Pearson相关分析和Mantel检验揭示环境因子、微生物群落与碳循环功能基因的关系,并利用非线性回归分析MAOC/POC比值与环境因子的响应关系。
本作品采用
知识共享署名
4.0 国际许可协议进行许可。
| # | 标题 | 文件大小 |
|---|---|---|
| 1 | 昆仑山中段北坡土壤理化性质数据.xlsx | 17.0 KiB |
中国·新疆乌鲁木齐市北京南路818号, 830011, 电话: 0991-7823121
